Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.4 ms