Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFXL1Q6ZNB6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFXL1Q6ZNB6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms