Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L3Q6VB84 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms