Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW78

UQCC3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC3Q6UW78 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UQCC3Q6UW78 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UQCC3Q6UW78 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms