Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF4Q2M2E3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ODF4Q2M2E3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms