Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSTF3Q12996 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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