Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNA1Q09470 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms