Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL6Q02878 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms