Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGGT1BP53609 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGGT1BP53609 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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