Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX1P22670 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX1P22670 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX1P22670 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX1P22670 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX1P22670 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX1P22670 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX1P22670 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX1P22670 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX1P22670 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX1P22670 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX1P22670 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX1P22670 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX1P22670 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX1P22670 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX1P22670 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX1P22670 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX1P22670 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX1P22670 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX1P22670 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX1P22670 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX1P22670 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX1P22670 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX1P22670 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX1P22670 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX1P22670 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX1P22670 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX1P22670 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX1P22670 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX1P22670 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX1P22670 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX1P22670 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX1P22670 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX1P22670 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX1P22670 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX1P22670 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX1P22670 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX1P22670 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX1P22670 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX1P22670 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX1P22670 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX1P22670 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX1P22670 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX1P22670 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX1P22670 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX1P22670 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX1P22670 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX1P22670 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX1P22670 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX1P22670 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX1P22670 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX1P22670 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX1P22670 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX1P22670 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX1P22670 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX1P22670 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX1P22670 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX1P22670 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX1P22670 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX1P22670 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX1P22670 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX1P22670 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX1P22670 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX1P22670 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX1P22670 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX1P22670 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX1P22670 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX1P22670 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX1P22670 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX1P22670 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX1P22670 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX1P22670 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX1P22670 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX1P22670 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX1P22670 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX1P22670 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX1P22670 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX1P22670 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX1P22670 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX1P22670 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX1P22670 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms