Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCG2P13521 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCG2P13521 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCG2P13521 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCG2P13521 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCG2P13521 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCG2P13521 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCG2P13521 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCG2P13521 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCG2P13521 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCG2P13521 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCG2P13521 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCG2P13521 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCG2P13521 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCG2P13521 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCG2P13521 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCG2P13521 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCG2P13521 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCG2P13521 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCG2P13521 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCG2P13521 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCG2P13521 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCG2P13521 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCG2P13521 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCG2P13521 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCG2P13521 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCG2P13521 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCG2P13521 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCG2P13521 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCG2P13521 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCG2P13521 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCG2P13521 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCG2P13521 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCG2P13521 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCG2P13521 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCG2P13521 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCG2P13521 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCG2P13521 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCG2P13521 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCG2P13521 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCG2P13521 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCG2P13521 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCG2P13521 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCG2P13521 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCG2P13521 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCG2P13521 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCG2P13521 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCG2P13521 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCG2P13521 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCG2P13521 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCG2P13521 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCG2P13521 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCG2P13521 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCG2P13521 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCG2P13521 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCG2P13521 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCG2P13521 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCG2P13521 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCG2P13521 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCG2P13521 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SCG2P13521 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCG2P13521 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCG2P13521 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCG2P13521 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCG2P13521 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCG2P13521 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCG2P13521 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCG2P13521 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCG2P13521 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCG2P13521 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCG2P13521 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCG2P13521 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCG2P13521 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCG2P13521 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCG2P13521 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCG2P13521 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCG2P13521 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCG2P13521 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCG2P13521 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCG2P13521 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCG2P13521 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SCG2P13521 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG2P13521 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG2P13521 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG2P13521 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG2P13521 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG2P13521 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG2P13521 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG2P13521 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG2P13521 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG2P13521 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG2P13521 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG2P13521 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG2P13521 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG2P13521 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCG2P13521 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCG2P13521 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCG2P13521 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCG2P13521 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCG2P13521 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms