Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DMDP11532 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DMDP11532 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DMDP11532 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DMDP11532 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DMDP11532 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DMDP11532 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DMDP11532 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DMDP11532 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DMDP11532 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DMDP11532 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DMDP11532 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DMDP11532 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DMDP11532 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DMDP11532 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DMDP11532 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DMDP11532 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DMDP11532 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DMDP11532 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DMDP11532 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DMDP11532 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DMDP11532 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DMDP11532 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DMDP11532 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DMDP11532 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DMDP11532 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DMDP11532 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DMDP11532 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DMDP11532 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DMDP11532 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DMDP11532 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DMDP11532 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DMDP11532 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DMDP11532 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DMDP11532 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DMDP11532 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DMDP11532 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DMDP11532 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DMDP11532 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DMDP11532 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DMDP11532 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DMDP11532 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DMDP11532 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMDP11532 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMDP11532 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMDP11532 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMDP11532 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMDP11532 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMDP11532 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMDP11532 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMDP11532 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMDP11532 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMDP11532 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DMDP11532 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DMDP11532 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DMDP11532 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DMDP11532 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DMDP11532 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DMDP11532 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DMDP11532 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DMDP11532 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DMDP11532 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DMDP11532 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DMDP11532 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DMDP11532 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMDP11532 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DMDP11532 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMDP11532 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMDP11532 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMDP11532 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMDP11532 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMDP11532 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMDP11532 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMDP11532 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMDP11532 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMDP11532 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DMDP11532 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMDP11532 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMDP11532 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMDP11532 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMDP11532 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMDP11532 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMDP11532 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMDP11532 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMDP11532 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMDP11532 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMDP11532 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMDP11532 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMDP11532 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMDP11532 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMDP11532 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMDP11532 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DMDP11532 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMDP11532 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMDP11532 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMDP11532 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMDP11532 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMDP11532 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMDP11532 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMDP11532 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 709.6 ms