Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT3O95395 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GCNT3O95395 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms