Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BHMG1C9JSJ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMG1C9JSJ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms