Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
U3KQE9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
U3KQE9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
U3KQE9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
U3KQE9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
U3KQE9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
U3KQE9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
U3KQE9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
U3KQE9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
U3KQE9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
U3KQE9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U3KQE9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
U3KQE9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U3KQE9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U3KQE9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
U3KQE9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U3KQE9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
U3KQE9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
U3KQE9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
U3KQE9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U3KQE9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
U3KQE9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U3KQE9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
U3KQE9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
U3KQE9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U3KQE9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U3KQE9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U3KQE9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U3KQE9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
U3KQE9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U3KQE9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U3KQE9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
U3KQE9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
U3KQE9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U3KQE9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
U3KQE9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
U3KQE9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
U3KQE9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
U3KQE9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
U3KQE9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
U3KQE9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
U3KQE9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
U3KQE9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U3KQE9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U3KQE9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
U3KQE9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U3KQE9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U3KQE9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
U3KQE9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U3KQE9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
U3KQE9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U3KQE9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U3KQE9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
U3KQE9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
U3KQE9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
U3KQE9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
U3KQE9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
U3KQE9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U3KQE9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U3KQE9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
U3KQE9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U3KQE9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U3KQE9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms