Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DKK2Q9UBU2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms