Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
USP35Q9P2H5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
USP35Q9P2H5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
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