Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO1B3Q9NPD5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms