Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF479Q96JC4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms