Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms