Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
LRRC9Q6ZRR7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
LRRC9Q6ZRR7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms