Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAPPA-AS1Q5QFB9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAPPA-AS1Q5QFB9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms