Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ME3Q16798 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ME3Q16798 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ME3Q16798 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ME3Q16798 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ME3Q16798 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ME3Q16798 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ME3Q16798 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ME3Q16798 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ME3Q16798 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ME3Q16798 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ME3Q16798 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ME3Q16798 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ME3Q16798 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ME3Q16798 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ME3Q16798 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ME3Q16798 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ME3Q16798 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ME3Q16798 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ME3Q16798 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ME3Q16798 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ME3Q16798 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ME3Q16798 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ME3Q16798 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ME3Q16798 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ME3Q16798 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ME3Q16798 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ME3Q16798 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ME3Q16798 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ME3Q16798 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ME3Q16798 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ME3Q16798 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ME3Q16798 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ME3Q16798 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ME3Q16798 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ME3Q16798 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ME3Q16798 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ME3Q16798 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ME3Q16798 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ME3Q16798 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ME3Q16798 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ME3Q16798 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ME3Q16798 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ME3Q16798 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME3Q16798 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME3Q16798 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME3Q16798 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME3Q16798 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME3Q16798 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME3Q16798 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ME3Q16798 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME3Q16798 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME3Q16798 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ME3Q16798 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME3Q16798 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME3Q16798 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME3Q16798 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME3Q16798 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME3Q16798 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME3Q16798 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME3Q16798 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME3Q16798 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME3Q16798 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME3Q16798 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME3Q16798 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME3Q16798 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME3Q16798 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME3Q16798 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME3Q16798 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ME3Q16798 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ME3Q16798 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ME3Q16798 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ME3Q16798 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ME3Q16798 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ME3Q16798 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ME3Q16798 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ME3Q16798 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ME3Q16798 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ME3Q16798 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ME3Q16798 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ME3Q16798 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ME3Q16798 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ME3Q16798 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ME3Q16798 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ME3Q16798 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ME3Q16798 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ME3Q16798 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ME3Q16798 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ME3Q16798 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ME3Q16798 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ME3Q16798 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ME3Q16798 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ME3Q16798 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ME3Q16798 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ME3Q16798 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ME3Q16798 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ME3Q16798 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ME3Q16798 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ME3Q16798 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ME3Q16798 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
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