Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1D2Q14995 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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