Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HNF4GQ14541 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms