Protein–RNA interactions for Protein: Q03330

GCN5, Histone acetyltransferase GCN5, yeastyeast

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN5Q03330 YLR161WYLR161W 345 nt5.78□□□□□ -1.48
GCN5Q03330 MRPS17YMR188C 714 nt5.78□□□□□ -1.48
GCN5Q03330 MTF1YMR228W 1026 nt5.78□□□□□ -1.48
GCN5Q03330 PGA2YNL149C 390 nt5.78□□□□□ -1.48
GCN5Q03330 CAR1YPL111W 1002 nt5.78□□□□□ -1.48
GCN5Q03330 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.78□□□□□ -1.48
GCN5Q03330 CRZ1YNL027W 2037 nt5.77□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 TEA1YOR337W 2280 nt5.77□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 DUG1YFR044C 1446 nt5.77□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YDR282CYDR282C 1245 nt5.77□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 VMA16YHR026W 642 nt5.77□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 GAT4YIR013C 366 nt5.77□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 SMD3YLR147C 306 nt5.77□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YLR379WYLR379W 375 nt5.77□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 SPC2YML055W 537 nt5.77□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 NOP13YNL175C 1212 nt5.77□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 RDL1YOR285W 420 nt5.77□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 CWC27YPL064C 906 nt5.77□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YHL012WYHL012W 1482 nt5.77□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 ERC1YHR032W 1746 nt5.77□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YIR007WYIR007W 2295 nt5.76□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.76□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 KNH1YDL049C 807 nt5.76□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 AIM6YDL237W 1173 nt5.76□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt5.76□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.76□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 PGU1YJR153W 1086 nt5.76□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 USB1YLR132C 873 nt5.76□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 ROX3YBL093C 663 nt5.76□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 MLC2YPR188C 492 nt5.76□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 CEG1YGL130W 1380 nt5.76□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 RTT106YNL206C 1368 nt5.76□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 ALG1YBR110W 1350 nt5.76□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YNL247WYNL247W 2304 nt5.76□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 CMR1YDL156W 1569 nt5.76□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 SRO9YCL037C 1305 nt5.75□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YME1YPR024W 2244 nt5.75□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 TEL2YGR099W 2067 nt5.75□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 ASN1YPR145W 1719 nt5.75□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 COX26YDR119W-A 201 nt5.75□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 MHR1YDR296W 681 nt5.75□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YER186CYER186C 921 nt5.75□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 CCE1YKL011C 1062 nt5.75□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YKL202WYKL202W 582 nt5.75□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 MRPL13YKR006C 795 nt5.75□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 MMM1YLL006W 1281 nt5.75□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 PIN2YOR104W 849 nt5.75□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 ATP20YPR020W 348 nt5.75□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 LDH1YBR204C 1128 nt5.75□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 TGL1YKL140W 1647 nt5.74□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 PYC1YGL062W 3537 nt5.74□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 HTB1YDR224C 396 nt5.74□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.74□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 BMH1YER177W 804 nt5.74□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 CUP1-1YHR053C 186 nt5.74□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 CUP1-2YHR055C 186 nt5.74□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 TFS1YLR178C 660 nt5.74□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 SEC13YLR208W 894 nt5.74□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 REH1YLR387C 1299 nt5.74□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 GAA1YLR088W 1845 nt5.74□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 ADE13YLR359W 1449 nt5.74□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 DBP9YLR276C 1785 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 RNH202YDR279W 1053 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 KRE9YJL174W 831 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YJU2YKL095W 837 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 CMC1YKL137W 336 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 LDB18YLL049W 540 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 TAL1YLR354C 1008 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 RUF20RUF20 443 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 TEX1YNL253W 1269 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 PSH1YOL054W 1221 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 STE50YCL032W 1041 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YMR155WYMR155W 1644 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 PKC1YBL105C 3456 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 HSP78YDR258C 2436 nt5.73□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 GUF1YLR289W 1938 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YDL057WYDL057W 987 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 MOB2YFL034C-B 864 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YGL262WYGL262W 528 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YHB1YGR234W 1200 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 CDC11YJR076C 1248 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 RCN1YKL159C 636 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 COS9YKL219W 1224 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YLR456WYLR456W 615 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YIM2YMR151W 438 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YBR013CYBR013C 390 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 ERI1YPL096C-A 207 nt5.72□□□□□ -1.49
GCN5Q03330 YCL041CYCL041C 495 nt5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.8 ms