Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFRP42898 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms