Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESR1P03372 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ESR1P03372 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESR1P03372 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESR1P03372 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESR1P03372 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESR1P03372 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESR1P03372 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ESR1P03372 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESR1P03372 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESR1P03372 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESR1P03372 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESR1P03372 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESR1P03372 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESR1P03372 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESR1P03372 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESR1P03372 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESR1P03372 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESR1P03372 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESR1P03372 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESR1P03372 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESR1P03372 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESR1P03372 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESR1P03372 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESR1P03372 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESR1P03372 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESR1P03372 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESR1P03372 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESR1P03372 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESR1P03372 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESR1P03372 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESR1P03372 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESR1P03372 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESR1P03372 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESR1P03372 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESR1P03372 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESR1P03372 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESR1P03372 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESR1P03372 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESR1P03372 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESR1P03372 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESR1P03372 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ESR1P03372 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESR1P03372 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESR1P03372 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESR1P03372 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESR1P03372 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESR1P03372 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESR1P03372 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESR1P03372 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESR1P03372 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESR1P03372 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESR1P03372 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESR1P03372 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESR1P03372 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESR1P03372 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESR1P03372 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESR1P03372 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESR1P03372 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ESR1P03372 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESR1P03372 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESR1P03372 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESR1P03372 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESR1P03372 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESR1P03372 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESR1P03372 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESR1P03372 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESR1P03372 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESR1P03372 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESR1P03372 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESR1P03372 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESR1P03372 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESR1P03372 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESR1P03372 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESR1P03372 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ESR1P03372 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESR1P03372 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESR1P03372 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ESR1P03372 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESR1P03372 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms