Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC7A4O43246 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.9 ms