Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
N4BP3O15049 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms