Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A2O14975 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1427.4 ms