Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARID3CA6NKF2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARID3CA6NKF2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms