Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2BA2VCK2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC2BA2VCK2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 644.9 ms