Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC53.97■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC53.97■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.96■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC53.96■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC53.96■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC53.96■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC53.96■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC53.96■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.95■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC53.95■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC53.95■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.95■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.95■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC53.95■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.95■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.95■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.95■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC53.94■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC53.94■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.94■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.94■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC53.93■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC53.93■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC53.93■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC53.93■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC53.92■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.92■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC53.92■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC53.91■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC53.9■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.89■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC53.88■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC53.88■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.88■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.88■■■■■ 6.22
NISCHQ9Y2I1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.87■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.87■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.86■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC53.86■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC53.86■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC53.86■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC53.86■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.85■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.84■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.84■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC53.84■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC53.84■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC53.83■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.83■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.83■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.83■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC53.83■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.82■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.82■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC53.82■■■■■ 6.21
NISCHQ9Y2I1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC53.81■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC53.81■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC53.8■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC53.8■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.8■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC53.8■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC53.8■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC53.79■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC53.79■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC53.79■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC53.79■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.79■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.79■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC53.79■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.78■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC53.78■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC53.78■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC53.78■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC53.78■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.77■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.77■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC53.77■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.76■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC53.76■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC53.76■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC53.76■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC53.76■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC53.76■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC53.75■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.75■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC53.75■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC53.75■■■■■ 6.2
NISCHQ9Y2I1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC53.75■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC53.74■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC53.74■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.74■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.74■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.74■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC53.74■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.74■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.73■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC53.73■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC53.73■■■■■ 6.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms