Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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LINC00474Q9P2X8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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LINC00474Q9P2X8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00474Q9P2X8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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LINC00474Q9P2X8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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LINC00474Q9P2X8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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LINC00474Q9P2X8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00474Q9P2X8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LINC00474Q9P2X8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00474Q9P2X8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LINC00474Q9P2X8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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LINC00474Q9P2X8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00474Q9P2X8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00474Q9P2X8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00474Q9P2X8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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LINC00474Q9P2X8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00474Q9P2X8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00474Q9P2X8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00474Q9P2X8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00474Q9P2X8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00474Q9P2X8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00474Q9P2X8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00474Q9P2X8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00474Q9P2X8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00474Q9P2X8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00474Q9P2X8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00474Q9P2X8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00474Q9P2X8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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