Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PNPLA3Q9NST1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPLA3Q9NST1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms