Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASS4Q9NQ75 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms