Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNBD2Q96M20 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms