Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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