Protein–RNA interactions for Protein: Q96HC4

PDLIM5, PDZ and LIM domain protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM5Q96HC4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM5Q96HC4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms