Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATXN7L3BQ96GX2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN7L3BQ96GX2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms