Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GCC1Q96CN9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GCC1Q96CN9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms