Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARHGEF28Q8N1W1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARHGEF28Q8N1W1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ARHGEF28Q8N1W1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
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