Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP49Q70CQ1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP49Q70CQ1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP49Q70CQ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP49Q70CQ1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP49Q70CQ1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP49Q70CQ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP49Q70CQ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP49Q70CQ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP49Q70CQ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP49Q70CQ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP49Q70CQ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP49Q70CQ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP49Q70CQ1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP49Q70CQ1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
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