Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L3Q5GJ75 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L3Q5GJ75 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms