Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA3Q16787 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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