Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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NRF1Q16656 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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NRF1Q16656 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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NRF1Q16656 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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NRF1Q16656 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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NRF1Q16656 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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