Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD8Q15843 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8Q15843 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8Q15843 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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