Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTP4A2Q12974 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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