Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 RBD2YPL246C 789 nt6.43□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 snR3snR3 194 nt6.43□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 TRK2YKR050W 2670 nt6.43□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 TED1YIL039W 1422 nt6.42□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 CRZ1YNL027W 2037 nt6.42□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 QDR3YBR043C 2070 nt6.42□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 ABZ1YNR033W 2364 nt6.42□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 COX26YDR119W-A 201 nt6.42□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 PDE1YGL248W 1110 nt6.42□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 PPE1YHR075C 1203 nt6.42□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 PAU17YLL025W 375 nt6.42□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 DCP1YOL149W 696 nt6.42□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 CAR1YPL111W 1002 nt6.42□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 VAN1YML115C 1608 nt6.42□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 KAR5YMR065W 1515 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 CLN2YPL256C 1638 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YGR176WYGR176W 348 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 HYM1YKL189W 1200 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 ARG1YOL058W 1263 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 RPN8YOR261C 1017 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YER137C-AYER137C-A 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YER159C-AYER159C-A 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YJR026WYJR026W 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YJR028WYJR028W 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YAR010CYAR010C 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YML040WYML040W 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YML045W-AYML045W-A 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YMR051CYMR051C 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 HSF1YGL073W 2502 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 MTC1YJL123C 1437 nt6.41□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 RPL12AYEL054C 498 nt6.4□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 SAW1YAL027W 786 nt6.4□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 SPC3YLR066W 555 nt6.4□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YLR317WYLR317W 435 nt6.4□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 YLR374CYLR374C 390 nt6.4□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 SPS18YNL204C 903 nt6.4□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 DAL82YNL314W 768 nt6.4□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 TLG2YOL018C 1194 nt6.4□□□□□ -1.38
SSF2Q12153 KEL1YHR158C 3495 nt6.4□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 TEF1YPR080W 1377 nt6.4□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 TEF2YBR118W 1377 nt6.4□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 CLB1YGR108W 1416 nt6.4□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 MET3YJR010W 1536 nt6.4□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 SHE10YGL228W 1734 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 PRM2YIL037C 1971 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 YDL034WYDL034W 345 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 BUD30YDL151C 582 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 SHR3YDL212W 633 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 GCV1YDR019C 1203 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 YIL028WYIL028W 399 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 SFH5YJL145W 885 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 RPS0BYLR048W 759 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 TFB6YOR352W 1032 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 HIR1YBL008W 2523 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 PTM1YKL039W 1572 nt6.39□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 SKN1YGR143W 2316 nt6.38□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 EFT2YDR385W 2529 nt6.38□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 EFT1YOR133W 2529 nt6.38□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 MRPL32YCR003W 552 nt6.38□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 YCR016WYCR016W 873 nt6.38□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 RRP17YDR412W 708 nt6.38□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 YGR168CYGR168C 1131 nt6.38□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 PCT1YGR202C 1275 nt6.38□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 YIL152WYIL152W 708 nt6.38□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 PGU1YJR153W 1086 nt6.38□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 GEP5YLR091W 882 nt6.38□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 TFS1YLR178C 660 nt6.38□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 YML090WYML090W 387 nt6.38□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 CLB2YPR119W 1476 nt6.38□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 GYP1YOR070C 1914 nt6.38□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 YFL042CYFL042C 2025 nt6.37□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 YAP1801YHR161C 1914 nt6.37□□□□□ -1.39
SSF2Q12153 VMA13YPR036W 1437 nt6.37□□□□□ -1.39
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